MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 1163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TAGA	2	8	224	231	50 %	25 %	25 %	0 %	406025742
2	NC_018606	TC	3	6	256	261	0 %	50 %	0 %	50 %	406025742
3	NC_018606	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
4	NC_018606	TAA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
5	NC_018606	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
6	NC_018606	CTTT	2	8	331	338	0 %	75 %	0 %	25 %	406025742
7	NC_018606	TTA	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
8	NC_018606	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025742
9	NC_018606	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	406025742
10	NC_018606	T	7	7	447	453	0 %	100 %	0 %	0 %	406025742
11	NC_018606	CCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025742
12	NC_018606	TTG	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025742
13	NC_018606	TTC	2	6	669	674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
14	NC_018606	GTTT	2	8	688	695	0 %	75 %	25 %	0 %	406025742
15	NC_018606	AC	3	6	731	736	50 %	0 %	0 %	50 %	406025742
16	NC_018606	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
17	NC_018606	T	6	6	797	802	0 %	100 %	0 %	0 %	406025742
18	NC_018606	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
19	NC_018606	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
20	NC_018606	GTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025742
21	NC_018606	CCTTTA	2	12	1114	1125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025742
22	NC_018606	AGC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025742
23	NC_018606	ACT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025742
24	NC_018606	ACG	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025743
25	NC_018606	ATG	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
26	NC_018606	AAGA	2	8	1611	1618	75 %	0 %	25 %	0 %	406025743
27	NC_018606	GTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
28	NC_018606	ATA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
29	NC_018606	A	6	6	1702	1707	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
30	NC_018606	TAT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
31	NC_018606	CTCAG	2	10	1746	1755	20 %	20 %	20 %	40 %	406025743
32	NC_018606	AGG	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025743
33	NC_018606	A	6	6	1836	1841	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
34	NC_018606	TA	3	6	1845	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	406025743
35	NC_018606	TTCA	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	406025743
36	NC_018606	CTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
37	NC_018606	GTG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025743
38	NC_018606	T	6	6	1986	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	406025743
39	NC_018606	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
40	NC_018606	A	7	7	2024	2030	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
41	NC_018606	CAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
42	NC_018606	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
43	NC_018606	AGA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
44	NC_018606	AGA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
45	NC_018606	AGA	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
46	NC_018606	AGA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
47	NC_018606	GAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
48	NC_018606	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
49	NC_018606	ATA	2	6	2372	2377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
50	NC_018606	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
51	NC_018606	TAT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025744
52	NC_018606	AGAT	2	8	2650	2657	50 %	25 %	25 %	0 %	406025744
53	NC_018606	ACC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025744
54	NC_018606	ATA	2	6	2861	2866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
55	NC_018606	TCC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025744
56	NC_018606	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
57	NC_018606	TAA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
58	NC_018606	T	6	6	3062	3067	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
59	NC_018606	CAGGC	2	10	3086	3095	20 %	0 %	40 %	40 %	406025745
60	NC_018606	AAT	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
61	NC_018606	T	7	7	3158	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
62	NC_018606	T	6	6	3168	3173	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
63	NC_018606	TTG	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
64	NC_018606	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
65	NC_018606	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
66	NC_018606	CTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
67	NC_018606	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	406025746
68	NC_018606	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
69	NC_018606	TC	3	6	3825	3830	0 %	50 %	0 %	50 %	406025746
70	NC_018606	CAG	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025746
71	NC_018606	GTA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
72	NC_018606	TTA	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
73	NC_018606	CTAT	2	8	3899	3906	25 %	50 %	0 %	25 %	406025746
74	NC_018606	TAT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
75	NC_018606	TA	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	406025746
76	NC_018606	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
77	NC_018606	AG	3	6	4144	4149	50 %	0 %	50 %	0 %	406025746
78	NC_018606	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
79	NC_018606	A	6	6	4242	4247	100 %	0 %	0 %	0 %	406025746
80	NC_018606	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
81	NC_018606	AAG	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
82	NC_018606	GAA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
83	NC_018606	AGA	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
84	NC_018606	AGA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
85	NC_018606	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
86	NC_018606	AAG	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
87	NC_018606	AAG	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
88	NC_018606	GAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
89	NC_018606	TAA	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
90	NC_018606	ATT	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
91	NC_018606	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	406025747
92	NC_018606	T	6	6	4944	4949	0 %	100 %	0 %	0 %	406025747
93	NC_018606	TATT	2	8	4987	4994	25 %	75 %	0 %	0 %	406025747
94	NC_018606	TGATCT	2	12	5014	5025	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025747
95	NC_018606	TAC	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
96	NC_018606	TGGA	2	8	5087	5094	25 %	25 %	50 %	0 %	406025747
97	NC_018606	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
98	NC_018606	A	7	7	5121	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	406025747
99	NC_018606	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	406025747
100	NC_018606	TA	3	6	5201	5206	50 %	50 %	0 %	0 %	406025747
101	NC_018606	CTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
102	NC_018606	TTTTCT	2	12	5274	5285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025747
103	NC_018606	CTT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
104	NC_018606	CAT	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
105	NC_018606	TTC	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
106	NC_018606	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025747
107	NC_018606	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025747
108	NC_018606	TCTA	2	8	6043	6050	25 %	50 %	0 %	25 %	406025748
109	NC_018606	TCT	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025748
110	NC_018606	CAAT	2	8	6098	6105	50 %	25 %	0 %	25 %	406025748
111	NC_018606	AGA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
112	NC_018606	A	7	7	6137	6143	100 %	0 %	0 %	0 %	406025748
113	NC_018606	A	7	7	6200	6206	100 %	0 %	0 %	0 %	406025748
114	NC_018606	AGC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
115	NC_018606	CTG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
116	NC_018606	TAT	2	6	6266	6271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
117	NC_018606	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
118	NC_018606	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025748
119	NC_018606	ATC	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
120	NC_018606	T	6	6	6469	6474	0 %	100 %	0 %	0 %	406025748
121	NC_018606	A	6	6	6486	6491	100 %	0 %	0 %	0 %	406025748
122	NC_018606	A	7	7	6543	6549	100 %	0 %	0 %	0 %	406025748
123	NC_018606	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
124	NC_018606	ACAA	2	8	6587	6594	75 %	0 %	0 %	25 %	406025748
125	NC_018606	TTG	3	9	6611	6619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025748
126	NC_018606	AT	3	6	6628	6633	50 %	50 %	0 %	0 %	406025748
127	NC_018606	TCAA	2	8	6639	6646	50 %	25 %	0 %	25 %	406025748
128	NC_018606	GTC	2	6	6651	6656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
129	NC_018606	C	6	6	6663	6668	0 %	0 %	0 %	100 %	406025748
130	NC_018606	GAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
131	NC_018606	ATT	3	9	6709	6717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
132	NC_018606	TTAACG	2	12	6732	6743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025748
133	NC_018606	GCA	3	9	6775	6783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
134	NC_018606	GTC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
135	NC_018606	CTA	2	6	6814	6819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025749
136	NC_018606	A	6	6	6862	6867	100 %	0 %	0 %	0 %	406025749
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264	NC_018606	CTT	2	6	12383	12388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025756
265	NC_018606	CTTT	2	8	12394	12401	0 %	75 %	0 %	25 %	406025756
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